Confirmación de una re infección de COVID-19 mediante secuenciación del genoma completo

Por Killian Meara

Una de las preguntas más importantes que se ha hecho durante la pandemia de COVID-19 es la de una posible reinfección por el virus. Si bien todavía no hay una respuesta definitiva, parece que la mayoría de las personas que tenían COVID-19 están protegidas durante al menos 6 meses después de la infección.

Un estudio realizado en Dinamarca mostró resultados en marzo que sugerían que los menores de 65 años tenían un 80% de posibilidades de protección contra la reinfección con COVID-19, mientras que los pacientes mayores a 65 años tenían alrededor del 47% de protección.

La mayoría de los casos de COVID-19 se detectan mediante pruebas de reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR), que funcionan durante varias semanas después de una infección. Sin embargo, discernir la positividad persistente de RT-PCR frente a una reinfección por COVID-19 es un desafío. Debido a esto, se desconoce la frecuencia de una reinfección.

Recientemente, un grupo de investigadores se propuso determinar la frecuencia de reinfección clínicamente sospechada y confirmar la reinfección mediante secuenciación viral del genoma completo (WGS).

La investigación se presentó en la Conferencia de la Sociedad de Epidemiología de la Atención Médica de América 2021 ,

El estudio incluyó a 13.603 pacientes y se llevó a cabo en los Hospitales y Clínicas de la Universidad de Iowa (UIHC), un centro médico académico de 811 camas. Los pacientes fueron identificados si tenían un caso previamente confirmado de COVID-19 y buscaban atención por problemas respiratorios. Luego, los investigadores realizaron WGS utilizando la tecnología Oxford Nanopore y los protocolos de la red ARTIC para confirmar la re infección.

Los hallazgos del estudio mostraron que de los pacientes con una prueba de RT-PCR positiva, 296 tuvieron una visita clínica por la aparición de nuevos síntomas y a quienes se le repitió otra PCR > 45 días después de la prueba inicial. De ellos, 29 tuvieron una prueba de repetición positiva y de ellos, 7 tuvieron valores de Ct <33, preocupantes por la reinfección.

“En pacientes con antecedentes recientes de infección por COVID-19, la repetición de las pruebas para detectar síntomas respiratorios fue poco frecuente”, escribieron los autores. “Algunos tuvieron una RT-PCR positiva en las pruebas sucesivas, pero solo uno de cada cuatro tenía valores de Ct que sugerían una reinfección. Confirmamos un caso de reinfección usando WGS”.

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