Damian McNamara
La mayoría de las cepas del virus SARS-CoV-2 presentan una mutación específica que las hace más transmisibles, hasta el punto de que estas cepas ahora predominan a nivel mundial, según muestra nueva evidencia.
En contraste con una mayor variedad de cepas al principio de la pandemia, ahora el 99,9% de las cepas de SARS-CoV-2 circulantes en el estudio presentan la mutación D614G en la proteína de pico. Además, las personas infectadas con una cepa D614G tienen cargas virales nasofaríngeas más altas en el momento del diagnóstico.
No todo son malas noticias. Esta mutación de un solo punto no se asoció con una peor gravedad clínica de COVID-19. Además, no se espera que la mutación interfiera con la eficacia de ninguno de los cócteles de anticuerpos, terapias de moléculas pequeñas o vacunas en desarrollo.
Dr. Ilya Finkelstein
Además, «por muy malo que sea el SARS-CoV-2, es posible que hayamos esquivado una bala en términos de la rapidez con la que muta», dijo a Medscape Noticias Médicas el autor del estudio, Ilya Finkelstein, PhD . Este virus muta mucho más lento que el VIH , por ejemplo, lo que brinda a los investigadores una mayor oportunidad de ir un paso por delante, dijo.
Detección molecular
La investigación fue posible porque los colegas del sistema del Hospital Metodista de Houston secuenciaron el genoma de 5085 cepas de SARS-CoV-2 al comienzo del brote y durante una segunda ola de infección durante el verano, dijo Finkelstein.
La fuente de datos única también incluye información de plasma, plasma de convalecencia y resultados de los pacientes. El estudio de una población grande y diversa en un área metropolitana importante como Houston ayuda a crear una «huella molecular» del virus que seguirá siendo muy útil, dijo Finkelstein, investigador y director del Laboratorio Finkelstein de la Universidad de Texas Austin.
D614G fue la sustitución genética más común que encontraron los investigadores, apareciendo en el 82% de las cepas de SARS-CoV-2 durante la primera ola del 5 de marzo al 11 de mayo. La proporción con esta mutación saltó al 99,9% en la segunda ola, definida como mayo 12 al 7 de julio en el estudio.
El salto en la frecuencia de las mutaciones «ocurrió muy rápidamente, en cuestión de unos pocos meses», señalan los investigadores.
La presencia de la mutación durante la primera oleada se asoció de forma independiente con los días de ventilación mecánica , la duración total de la estancia y la duración de la estancia en la UCI. Sin embargo, no se asoció con diferencias significativas en los resultados de los pacientes.
La mutación D614G es ahora tan común en todo el mundo que estos virus se consideran cepas de referencia. Los investigadores creen que la D614G predomina porque aumenta la capacidad de la proteína de pico de abrir células para que ingrese el virus.
A pesar de la gran cantidad de cepas de virus evaluadas, las muestras solo representan alrededor del 10% de los casos de COVID-19 en Houston durante el estudio, una posible limitación. Además, algunas muestras recolectadas no pudieron usarse para análisis del genoma de alta calidad debido al ácido nucleico del virus.
Además, no está claro si las interacciones inmunes entre el huésped y el virus desempeñan un papel importante. Sin embargo, los investigadores señalan en el artículo que «los datos disponibles sugieren que, en conjunto, la genética del huésped no juega un papel abrumador en la determinación del resultado en la gran mayoría de los pacientes adultos, una vez que se establece la infección por el virus».
Vigilancia en curso
«Los hallazgos nos ayudarán a comprender el origen, la composición y la trayectoria de futuras ondas de infección y el efecto potencial de la respuesta inmune del huésped y las maniobras terapéuticas en la evolución del SARS-CoV-2», añaden los investigadores.
En el futuro, la vigilancia molecular en curso del SARS-CoV-2 «puede proporcionar información crítica sobre el origen de los nuevos picos y olas de infección que están ocurriendo a medida que las restricciones de salud pública se relajan aún más, las escuelas y universidades reabren, las vacaciones ocurren, los viajes aéreos comerciales aumentan y los individuos cambian su comportamiento debido a la ‘fatiga’ de COVID-19 «, señalan los investigadores.
Añaden que los datos del genoma también serán útiles para evaluar la evolución molecular en curso en picos y otras proteínas «a medida que se genera la inmunidad de grupo de referencia, ya sea por exposición natural al SARS-CoV-2 o por vacunación».
Se requiere una validación adicional
«El estudio es muy interesante y está bien realizado», dijo a Medscape Noticias Médicas el profesor Noam Shomron, PhD, miembro de la facultad de medicina de la Universidad de Tel Aviv, Israel .
El análisis de la «evolución molecular del SARS-CoV-2 en una región específica de EE. UU. … podría verse como un microcosmos de lo que ocurre en otras grandes ciudades de EE. UU.», Dijo.
Sin embargo, «antes de sacar conclusiones precipitadas, esto debería validarse más», añadió Shomron, autor de un estudio que sugiere que las diferencias en los alelos genéticos podrían explicar parcialmente las variaciones entre países en las tasas de infección, gravedad y mortalidad asociadas con el SARS-CoV-2.
«Sabemos que muchas otras características podrían afectar los resultados, incluso las limitaciones sociales podrían generar un sesgo en las observaciones».